На сайте МОА «Черноземье» опубликован окончательный вариант календаря игр и регламент Кубка межрегиональной футбольной ассоциации 2016 года. По сравнению с первоначальным вариантом изменений немного, и касаются они исключительно сроков проведения матчей. Так, поединки первой стадии перенесены на две недели позже.
Напомним, что главным нововведением Кубка стало проведение на четвертьфинальной стадии мини-турнира с участием трёх команд, одна из которых выйдет в полуфинал. В этом мини-турнире сыграют коллективы из Воронежской области: «Олимпик», «Факел-М» и «Атом».
Представитель Липецкой области ФК «Елец» за выход в полуфинал сразится с новомосковским «Химиком».
1/4 финала. Первые матчи. 9 апреля, суббота. Ротор-Волгоград (Волгоград) — Локомотив-2 (Лиски), матч пройдёт в Лисках. Металлург-ОЭМК (Старый Оскол) — Авангард-2 (Курск). Химик (Новомосковск) — Елец (Елец).
1/4 финала. Ответные матчи. 16 апреля, суббота. Ротор-Волгоград — Локомотив-2. Авангард-2 — Металлург-ОЭМК. Елец — Химик.
1/4 финала. Мини-турнир. 2 апреля, суббота. Олимпик (Новая Усмань) — Факел-М (Воронеж). 9 апреля, суббота. Факел-М — Атом (Нововоронеж). 16 апреля, суббота. Атом — Олимпик.
Полуфиналы. 23 апреля, суббота. 30 апреля, суббота. Ротор-Волгоград/Локомотив-2 — Металлург-ОЭМК/Авангард-2. Победитель мини-турнира — Химик/Елец.
Финал. 20 июля, среда. 23 июля, суббота.
Регламент Кубка «Черноземья» (полное название — межрегиональный раунд Кубка России, зона «Черноземье») предусматривает выход победителя турнира в финальный этап Кубка России среди непрофессиональных клубов, который пройдёт в ноябре.